AlphaFold2 Benchmark ~ タンパク質の立体構造予測プログラム 更新日:2024年4月27日 HPC Benchmark タンパク質の立体構造予測プログラム AlphaFold2 (https://github.com/google-deepmind/alphafold)の ベンチマーク 結果を掲載します。AlphaFold2は、DeepM […] 続きを読む
MKL Linpack Benchmark 更新日:2024年4月23日 HPC Benchmark Intel MKL (Math Kernel Library) に含まれる Linpack ベンチマークを使用して継続的な CPU の性能評価を実施します。ベンチマークプログラムは、$MKLROOT/benchmarks […] 続きを読む
GENESIS Benchmark ~ 分子動力学シミュレーション 性能評価 ~ 更新日:2024年1月21日 HPC Benchmark 理化学研究所で開発されているGENESISはタンパク質、核酸、脂質、糖鎖、またはそれらの複合体など生体内高分子を対象にした分子動力学計算を行うためのソフトウェアです。 続きを読む
GROMACS Benchmark ~ 分子動力学シミュレーション 性能評価 ~ 更新日:2024年4月27日 HPC Benchmark Gromacs公式ページで紹介されているベンチマークテストADH_bench_systems の adh_cubic を実施した結果を御紹介。 続きを読む
MixBench ~ GPU の精度別性能評価 ~ 更新日:2024年1月16日 HPC Benchmark 歴代GPUの精度別(FP64, FP32, FP16, Int8)パフォーマンスをMixBenchを利用して実測評価。 続きを読む